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我们只要人为地将携带已知DNA序列标签的转座复合物（即带着红色蓝色测序标签的转座酶Tn5），加入到细胞核中，再利用已知序列的标签进行PCR后测序，就知道哪些区域是开放染色质了。而这也就是ATAC-seq的原理。
ATAC-seq出来的结果，和传统方法出来的结果具有很强的一致性，同时也和基于组蛋白修饰marker的ChIP-seq有较高的吻合程度。也就是说，ATAC-seq中的peak，往往是启动子、增强子序列，以及一些反式调控因子结合的位点。
相比起来，ATAC-seq的重复性，比MNase-seq和DNase-seq的更强，操作起来也更加简单，而且只需要很少的细胞/组织量，同时出来的信号更加漂亮。目前已经是研究染色质开放性首选的技术方法。
ATAC-seq技术流程
ATAC-seq技术应用
重大疾病发病机制：癌症、生殖系统、糖尿病等疾病发病机制；
药物相关研究：药物作用机制、新药研发、耐药性及敏感性研究；
潜在标志物预测：临床生物标志物发现、生物标志物功能研究；
染色体结构研究：染色体开发性图谱绘制、核小体定位预测、转录因子结合位点分析。
任喜梅? | 文案
科普讲堂|实时荧光定量PCR检测方法
测序技术是基因组学的核心技术，是基因组学最基本最重要的数据，也是生命科学领域大数据时代的核心组成部分。今天我来简单盘点一代、二代、三代测序技术的优劣势及应用情况。
一代测序是上世纪70年代由Sanger和Coulson开创的DNA双脱氧链终止法测序，也称为Sanger测序。在1977年完成第一个基因组序列（噬菌体X174），全长共计5375个碱基。2001年完成的首个人类基因组图谱就是以改进了的Sanger法为其测序基础。
Sanger测序原理： 在4个DNA合成反应体系（含dNTP）中分别加入一定比例带有标记的ddN
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评论列表（4条）
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